Śledczy Carlos Mendoza, początkowo przydzielony do sprawy, opracował konkretną teorię. Prawdopodobnie grupa przestępcza zidentyfikowała młodą kobietę jako potencjalny cel, nie badając dokładnie jej rzeczywistej sytuacji finansowej. Kiedy zdali sobie sprawę ze swojego błędu, prawdopodobnie postanowili ją wyeliminować, aby uniknąć identyfikacji. Teoria ta wyjaśniała całkowity brak kontaktu po porwaniu.
W tradycyjnych przypadkach porwań przestępcy nawiązują kontakt z rodziną w celu wynegocjowania okupu. W przypadku Any nie było żadnych telefonów z żądaniem pieniędzy. Maria Teresa dostrzegła pewną logikę w tym wyjaśnieniu w pierwszych miesiącach poszukiwań. Pozwoliło jej to zachować nadzieję, że Ana wciąż żyje, przetrzymywana w jakimś odległym miejscu przez przestępców, którzy ostatecznie ją uwolnią.
potwierdzając, że rodzina nie mogła zapłacić okupu.
Druga ważna teoria wyłoniła się z komentarzy sąsiadów na temat nieznanego samochodu, który widziano poruszającego się po okolicy na kilka dni przed zaginięciem. Pani Maldonado wspominała, że zauważyła szarą limuzynę z tablicami rejestracyjnymi, których nie pamiętała, w której siedziało dwóch mężczyzn, którzy najwyraźniej obserwowali codzienne życie mieszkańców.
„Nie przywiązywałam do nich wtedy żadnej wagi” – powiedziała pani Maldonado śledczym. Pomyślałam, że mogą to być krewni nowego sąsiada lub sprzedawcy, ale teraz, kiedy o tym myślę, wydaje mi się dziwne, że tak długo przebywali w samochodzie. Ta informacja skłoniła mnie do intensywnych poszukiwań świadków, którzy mogliby dostarczyć dodatkowych informacji na temat podejrzanego pojazdu.
Przez kilka tygodni śledztwo koncentrowało się na lokalizowaniu podobnych samochodów, przeglądaniu rejestrów kradzieży i tworzeniu szkiców osób podróżujących. Teoria podejrzanego samochodu zajęła śledczym prawie sześć miesięcy, ale nigdy nie przyniosła żadnych konkretnych wskazówek prowadzących do Any.
Szkice nie pasowały do żadnego ze znanych przestępców w policyjnej bazie danych. Trzecia teoria, bardziej bolesna dla Marii Teresy, ale równie uporczywa, sugerowała, że Ana dobrowolnie zdecydowała się porzucić swoje życie w Monterrey, aby rozpocząć nowe w innym mieście. Niektórzy śledczy argumentowali, że 19-letnia kobieta, obciążona przytłaczającymi obowiązkami rodzinnymi i mająca niewiele możliwości rozwoju osobistego, mogła potajemnie zaplanować ucieczkę.
„Widzieliśmy podobne przypadki” – wyjaśniła Marii Teresie śledcza Mendoza. Młodzi ludzie, którzy odczuwają ciężar oczekiwań rodziny i decydują się na poszukiwanie niezależności bez bolesnych konfrontacji. Maria Teresa kategorycznie odrzuciła tę możliwość. Ana nigdy by mi czegoś takiego nie zrobiła.
Wiedziała, jak bardzo Jorge i Patricia jej potrzebują, a przede wszystkim kochała mnie za bardzo, by sprawiać mi takie cierpienie. Te trzy główne teorie zdominowały śledztwo w ciągu pierwszych dwóch lat po zaginięciu Any. Każda z nich zawierała przekonujące elementy, ale także istotne luki, które utrudniały poczynienie ostatecznych postępów. Żadna z teorii nie brała pod uwagę najprostszej, a jednocześnie najbardziej nie do pomyślenia możliwości: że Ana Morales nigdy nie opuściła dzielnicy Santa María i że przez cały okres poszukiwań pozostawała w odległości mniejszej niż
100 metrów od domu, w którym María Teresa opłakiwała jej nieobecność każdej nocy. Do 2007 roku, pięć lat po zaginięciu Any, oficjalne śledztwo praktycznie stanęło w miejscu. Akta sprawy zapełniły trzy pełne teczki w biurach Policji Ministerialnej, ale aktywne tropy zostały wyczerpane, nie przynosząc żadnych konkretnych rezultatów. María Teresa całkowicie odmieniła swoje życie, koncentrując się na poszukiwaniach Any.
